丹田のエネルギーが全身クンダリーニによって心地良く胴体、手足に流れたりするのですが、これは意図しながら出来るようになった方が良いでしょうか？

はい、その通りです。

更には、常に流れている状態がベストです。

なので、常日頃の練功で流れている状態を考えなくても出来るように、身体に癖つけることが大切です。

これから更に練功が進むと、今感じている以上のエネルギーが常に、居つかずに流れている状態になって行きます。